Göz rengini 16 farklı genin etkilediği düşünülmektedir ancak hala kesin olarak anlaşılamamıştır. 15. kromozomda bulunan OCA2 and HERC2 genlerinin en çok etkilediği bilinmektedir. OCA2 melanin üretimiyle ilgilidir ve bu genle ilgili bir problemde Albinizim hastalığı oluşur. HERC2 'de oluşan bir mutasyon ise gözde melanin üretilmesine engel olmakta ve renkli gözlere yol açmaktadır