Tomcat açılırken size özel parametreler vermek için çalıştırmadan önce JAVA_OPTS değişkeni set edilebilir.
Örneğin Windows'da ana dizine aşağıdaki gibi bir bat eklenebilir:
set JAVA_HOME=C:\Program Files\Java\jdk1.8.0_111
set JAVA_OPTS="-Dfibiler.appdir=Q:\app"
call bin\startup.bat
Görüldüğü gibi -Dfibiler.appdir parametresi verilmiştir.
Linux'da ise JAVA_OPTS set etme aşağıdaki gibi yapılır:
export JAVA_OPTS="-Dfibiler.appdir=Q:\app"